Кроме того, DATA USB в норме, на землю не коротят
Греются ещё ST75185C - компорты, может это норма для них 40-45 градусов на этой плате.... Подскажите куда дальше копать.
КЗ по USB у южных мостов VIA маловероятно. Этим страдают ICH5, реже ICH4.
Снять драйверы RS-232. Заменить SIO на заведомоисправный. Но до этих манипуляций, перешить БИОС и проверить.