Что-то нигде не нахожу, с какими LPT-портами работает софт.
В справке к программе все написано. Подключается к LPT1, порт должен быть в режиме EPP+ECP. Но зачем вам LPT? Плагин реализующий поддержку SPI флешек не работает через LPT, только через COM с железом типа PonyProg, JonisProg и т.д. Но если вы хотите узнать, что поддерживается через LPT, то подключив этот плагин, в меню выбора устройства можно это увидеть.